قصة المسلسل: مرت ثلاث سنوات من مغامرات الديجيمون في الموسم الأول وفي الموسم الثاني يقع العالم الرقمي في مشكلة كبيرة حيث أن فتى استطاع أن يمنع التطور الطبيعي وأراد أن يسيطر على العالم الرقمي إلا أن ثلاثة أطفال تم اختيارهم ليدعمو تاكيرو المختار وهيكاري لكي يقفو بالمرصاد للفتى الشرير محاولين في ذات الوقت عيش حياتهم الطبيعية في العالم الطبيعي